si al estar gestionando mediante rpm o yum algún paquete y encuentras los siguientes errores significa que la base de datos RPM corrompida
error: rpmdb: BDB0113 Thread/process 8321/140220614731584 failed: BDB1507 Thread died in Berkeley DB library
error: db5 error(-30973) from dbenv->failchk: BDB0087 DB_RUNRECOVERY: Fatal error, run database recovery
error: cannot open Packages index using db5 - (-30973)
error: cannot open Packages database in /var/lib/rpm
CRITICAL:yum.main:
Error: rpmdb open failed
Para solventar este problema tienes que eliminarla y reconstruirla de la siguiente forma:
mkdir /var/lib/rpm/backup
cp -a /var/lib/rpm/__db* /var/lib/rpm/backup/
rm -f /var/lib/rpm/__db.[0-9][0-9]*
rpm --quiet -qa
rpm --rebuilddb
yum clean all